Xây dựng bộ gen tham chiếu đầu tiên cho Bào ngư đen
Bào ngư đen (Haliotis cracherodii) từng có nhiều trong môi trường sống dưới vùng nước triều của California, cung cấp protein và những chiếc vỏ bóng bẩy cho những người bản địa sống cùng với chúng trong nhiều thiên niên kỷ. Khai thác thủy sản thương mại của Hoa Kỳ ban đầu tập trung vào những loài động vật thân mềm ăn cỏ, nhưng sau sự sụt giảm do thu hoạch quá mức đối với những loài động vật có vỏ đó, một ngành khai thác thủy sản thương mại quy mô lớn đối với bào ngư đen bắt đầu vào năm 1968, vào đầu những năm 1970 đã thu về hàng trăm tấn loài động vật này từ bờ biển mỗi năm. Sau đó, vào những năm 1980 và 1990 - khi bào ngư đen đã suy giảm - một căn bệnh do vi sinh vật tàn phá được gọi là hội chứng khô héo đã giết hàng triệu con bào ngư đen, xóa sổ hơn 80% tổng dân số. Điều này đã khiến Liên minh Bảo tồn Thiên nhiên Quốc tế (IUCN) chỉ định loài này là loài cực kỳ nguy cấp và đưa ra một loạt các biện pháp bảo vệ liên bang .
Vào năm 2020, Cơ quan Nghề cá Biển Quốc gia Hoa Kỳ đã xác định tám hành động chính cần thiết để bảo tồn và phục hồi các loài động vật, bao gồm đánh giá cấu trúc di truyền và sự đa dạng của các quần thể hoang dã. Trong khi một số nghiên cứu về di truyền học về bào ngư đen đã được công bố, việc hiểu sâu hơn về sinh học và sinh thái của loài vật này bị cản trở do không có nguồn gen. Vì vậy, để hỗ trợ công việc như vậy cũng như cung cấp những hiểu biết mới về loài ốc sên cực kỳ nguy cấp này, các nhà nghiên cứu từ Đại học California, Santa Cruz, đã xây dựng một bộ gen chất lượng tham chiếu cho loài này.
Các tác giả lưu ý rằng bộ gen này bổ sung vào 4 bộ gen được công bố trước đây của các loài Haliotis khác và là bộ gen đầu tiên của loài bào ngư cực kỳ nguy cấp, các tác giả lưu ý — thực tế, trong số hơn 3.200 bộ gen động vật của cơ sở dữ liệu NCBI , họ chỉ ra rằng chỉ 75 bộ đến từ động vật thân mềm mặc dù Mollusca là loài động vật lớn thứ hai.
Nhóm nghiên cứu viết trong bài báo: “Bộ gen tham chiếu của bào ngư đen sẽ là nguồn tài nguyên thiết yếu để hiểu lịch sử tiến hóa của loài này cũng như để khám phá mức độ đa dạng di truyền hiện tại và thiết lập các kế hoạch quản lý và phục hồi trong tương lai”. Việc giải trình tự bộ ben sẽ cho phép các nhà khoa học trả lời các câu hỏi chính về động vật, chẳng hạn như liệu có các biến thể gen liên quan đến tính kháng hoặc tính nhạy cảm với hội chứng khô héo và liệu cấu trúc quần thể của chúng có chỉ ra các rào cản sinh thái đối với sự phân tán và định cư cần được khắc phục bằng các hành động quản lý hay không.nên cho phép các nhà khoa học trả lời các câu hỏi quan trọng về động vật, chẳng hạn như liệu có các biến thể bộ gen liên quan đến tính kháng hoặc tính nhạy cảm với hội chứng khô héo và liệu cấu trúc quần thể của chúng có chỉ ra các rào cản sinh thái đối với sự phân tán và định cư cần được khắc phục bằng các hành động quản lý hay không.
https://www.mard.gov.vn/
